MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 25543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	TA	3	6	4	9	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	ATT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019738	GCG	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019738	GTAA	2	8	129	136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019738	CA	3	6	143	148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019738	AGA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019738	CCA	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019738	A	6	6	1730	1735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019738	TAG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019738	CAAAG	2	10	3486	3495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019738	GGA	2	6	6891	6896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019738	ATCT	2	8	7010	7017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019738	ATT	2	6	7050	7055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019738	TA	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019738	TAG	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019738	TGA	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019738	TC	3	6	7184	7189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019738	T	6	6	7226	7231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019738	TGA	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019738	TC	3	6	7272	7277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019738	CTAT	2	8	12054	12061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019738	ATAG	2	8	12062	12069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019738	AATGAA	2	12	12094	12105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019738	AT	3	6	13274	13279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019738	AGA	2	6	13349	13354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019738	GTT	2	6	13409	13414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019738	CTT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019738	ACT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019738	CTA	2	6	13894	13899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019738	ACA	2	6	14341	14346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019738	CTT	2	6	14364	14369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019738	AT	3	6	14443	14448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019738	TCTT	2	8	14456	14463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019738	GCA	2	6	14498	14503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019738	TGA	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019738	T	6	6	14556	14561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019738	ACA	2	6	14581	14586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019738	ATT	2	6	14659	14664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019738	CTC	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019738	CGG	2	6	14823	14828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019738	A	9	9	14836	14844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019738	TAGT	2	8	14921	14928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019738	TAA	2	6	14938	14943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019738	A	7	7	16168	16174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019738	AATT	2	8	16248	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019738	GCT	2	6	18679	18684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019738	TGG	2	6	18746	18751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019738	TA	3	6	18776	18781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019738	A	6	6	18946	18951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019738	A	6	6	18987	18992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019738	GGTA	2	8	19061	19068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019738	AGG	2	6	19228	19233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019738	CAT	2	6	19768	19773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019738	ATT	2	6	20597	20602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019738	ACA	2	6	20614	20619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019738	ATT	2	6	20631	20636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019738	CATT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019738	TTAGG	2	10	20666	20675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019738	CA	3	6	20676	20681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019738	CTTG	2	8	20702	20709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019738	GTCAAC	2	12	20723	20734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019738	CTC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_019738	TAA	2	6	24814	24819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019738	ATC	2	6	24895	24900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019738	TCT	2	6	24917	24922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019738	CCA	2	6	24955	24960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019738	TCT	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019738	CCT	2	6	25014	25019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019738	CTT	2	6	25029	25034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019738	CCT	2	6	25061	25066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019738	TA	3	6	25313	25318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019738	CAGC	2	8	25379	25386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019738	CTTT	2	8	25448	25455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019738	TCGT	2	8	25471	25478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019738	TGT	2	6	25487	25492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019738	TCT	2	6	25499	25504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019738	AGA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019738	GA	3	6	25559	25564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019738	CA	3	6	25589	25594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019738	CAAAAC	2	12	25674	25685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019738	CT	3	6	26093	26098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019738	ATCA	2	8	27647	27654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019738	A	6	6	27690	27695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019738	CAA	2	6	30473	30478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019738	A	7	7	30503	30509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019738	AGG	2	6	30527	30532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019738	TGT	2	6	30543	30548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019738	ATGA	2	8	30552	30559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019738	CGC	2	6	30606	30611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019738	GTTGAA	2	12	30683	30694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019738	TCGG	2	8	30747	30754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019738	TCCGC	2	10	30896	30905	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_019738	TCCC	2	8	30960	30967	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_019738	AGG	2	6	30983	30988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019738	CTC	2	6	30990	30995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019738	ACG	2	6	31039	31044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019738	GC	3	6	31350	31355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019738	AGG	2	6	31370	31375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019738	GCAG	2	8	31588	31595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019738	CT	3	6	31631	31636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019738	GCC	2	6	31727	31732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019738	CTT	2	6	31830	31835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019738	AG	4	8	31948	31955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019738	ACC	2	6	31982	31987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019738	CTT	2	6	32094	32099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019738	CGC	2	6	32116	32121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019738	GCTG	2	8	32161	32168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019738	GGA	2	6	32294	32299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019738	ATT	2	6	32430	32435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019738	GCT	2	6	32529	32534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019738	CCT	2	6	32545	32550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019738	CCT	2	6	32570	32575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019738	TGG	2	6	32608	32613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019738	CGA	2	6	32632	32637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019738	AGCT	2	8	32795	32802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019738	CCG	2	6	32842	32847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019738	TCGG	2	8	32859	32866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_019738	TCGCTT	2	12	32967	32978	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019738	TTC	2	6	33031	33036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019738	CA	3	6	33164	33169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019738	GCT	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019738	AAC	2	6	33359	33364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019738	TCGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019738	CTA	2	6	33395	33400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019738	TCC	2	6	33424	33429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019738	CTA	2	6	33432	33437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019738	TGCT	2	8	33529	33536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019738	TCG	2	6	33556	33561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019738	CTT	2	6	33573	33578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019738	TG	3	6	33585	33590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019738	TCT	2	6	33650	33655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019738	TTC	2	6	33669	33674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019738	TCT	2	6	33788	33793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019738	TTCTA	2	10	33873	33882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019738	ACC	2	6	33987	33992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019738	T	6	6	34037	34042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019738	CGAC	2	8	34051	34058	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_019738	AGG	2	6	34130	34135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019738	GT	3	6	34273	34278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019738	TCC	2	6	34333	34338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019738	TCGC	3	12	34403	34414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019738	GTA	2	6	34435	34440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019738	GT	3	6	34442	34447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019738	TCC	2	6	34493	34498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_019738	TC	3	6	34515	34520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019738	ATG	2	6	34537	34542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019738	CACGA	2	10	34592	34601	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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